Znanstveniki so v genomu prašičev odkrili družino edinstvenih kratkih ponovitev, ki so evolucijsko podobne podobnim ponovitvam pri primatih.
V projektu so sodelovali znanstveniki z univerze Jilin (Changchun, Kitajska) in Akademije za kmetijske znanosti (Heilongjiang, Kitajska) v sodelovanju s korporacijo Firefly BioWorks (ZDA).
Po analizi strukture in izvora PRE-1 (prašičji ponavljajoči se element, dobesedno - "prašičji ponavljajoči se element") so prišli do zaključka, da so lahko najbližji sorodniki primatov na nekdanji supercelini Lavrazija prašiči. Preprint raziskave je bil objavljen na strežniku bioRxiv 31. avgusta 2015.
Preučeni CDP (kratka disperzna ponovitev) PRE-1 se nahaja v medgeni regiji, približno 686 ~ 985 baznih parov pred začetkom gena, ki kodira protein, ki veže rastni faktor insulina (IGFBP7). Ponavljajoče se zaporedje 299 baznih parov PRE-1 smo primerjali s 40 različnimi ponovitvami Alu primatov in ugotovili pomembne podobnosti tako v samih zaporedjih kot v vzorcu porazdelitve njihovih ponovitev med kromosomi.
Napovedana sekundarna struktura RNA ponavlja PRE-1, zložena v model, podoben Alu-ponovitvam. Nazadnje je skupni izvor PRE-1 in Alu iz tako imenovane 7SL RNA (RNA za prepoznavanje signala) nakazoval njihovo evolucijsko podobnost in prašiče pripisal družini, ki v glavnem vključuje primate.
Prej so se znanstveniki pri gradnji filogenetskih dreves zanašali le na podobnosti in razlike genov, pri čemer so ignorirali dejstvo, da se je v celotnem genomu spremenil celoten genom, vključno z elementi, ki ne kodirajo beljakovin ali RNA in katerih pomen znanstvenikom še vedno ni jasen.
Promocijski video:
Ta študija, ki temelji na celostnem pristopu k analizi medgenih elementov, po mnenju avtorjev ponuja "zelo prepričljiva" dejstva, iz katerih je mogoče izpeljati evolucijske zaključke. Glede na te rezultate se predvideni čas razhajanja vrst premika s 65 na 80–100 milijonov let.