Udeleženci konzorcija Genome 10K na letni konferenci, ki zdaj poteka v New Yorku, so napovedali začetek mednarodnega projekta "Genomi vretenčarjev", njegova naloga je zbrati genom vseh 66 tisoč vrst vretenčarjev, ki danes živijo na planetu. Gizmodo pove več o ciljih in ciljih projekta.
Leta 2009 so ameriški biologi David Haussler, Oliver Ryder in Stephen O'Brien ustanovili projekt Genome 10K, katerega cilj je bil zaporedje 10.000 genomov vretenčarjev. Sprva je pri projektu sodelovalo 55 znanstvenikov iz velikih živalskih vrtov, raziskovalnih središč in muzejev. Sprva ni bilo jasno, kako dolgo bo trajalo, da se sestavijo dovolj kakovostni genomi. A z znižanjem stroškov in poenostavitvijo metod zaporedja je postalo jasno, da bo projekt svoje naloge dokončal v nekaj letih. V zadnjih treh letih so udeleženci projekta primerjali glavne tehnologije za zaporedje DNA in analizo dobljenih rezultatov, da bi izbrali tisto, ki bo ustvarila "platinaste genome".
Člani Genoma 10K so včeraj napovedali začetek novega projekta genomov vretenčarjev, katerega namen je zbrati moške in ženske genomov 66.000 vrst vretenčarjev. V projektu bo sodelovalo 150 znanstvenikov, ki bodo zastopali 50 organizacij iz 12 držav. Po mnenju enega od ustanoviteljev projekta Oliverja Ryderja bodo biologi posledično lahko razumeli razloge za izumrtje vrst, vključno s tem, ali so v zgodovini vrste obstajali tesno povezani križi, "ozka grla", zaradi česar se je genetska raznovrstnost vrste zmanjšala, ali izbrisi - mutacije, ki se lahko "izklopijo". »Geni, potrebni za preživetje organizma.
Skupaj z napovedjo novega projekta so znanstveniki takoj predstavili prve rezultate njegovega dela: genomi 15 vrst vretenčarjev, vključno z ogroženo papagajsko sovo kakapo, endemično za Novo Zelandijo, in avstralskim platipom. Ti in vsi drugi genomi, ki jih raziskovalci nameravajo zbrati, bodo objavljeni v javni domeni, v bazi podatkov Noah's Ark Genomic.
Udeleženci načrtujejo zaporedje kratkih odsekov genomske DNA in od njih zbirajo vedno daljša zaporedja do celotnega kromosoma, nato pa jih "prilepijo" z algoritmi, posebej razvitimi za projekt.
Prej so raziskovalci lahko na žepnem zaporedju pametnega telefona prebrali genom osebe. Naprava je postavila rekord najdaljšega odčitavanja molekule DNA, lahko je sekvencirala zaporedja do 882 tisoč baznih parov.
Ekaterina Rusakova
