Edini ljudje na planetu, katerih predniki se niso pomešali z neandertalci, so prebivalci Podsaharske Afrike. Nove raziskave so pokazale, da imajo celo prebivalci severnega dela Črnega kontinenta neandertalske gene.
Dekodiranje genoma naših najbližjih evolucijskih sorodnikov kaže, da DNK povprečnega Evrejca predstavlja 1-4% genskega materiala neandertalcev. Očitno je bil seks med predstavniki obeh vrst redko produktiven, a ne glede na to, koliko potomcev je bilo, je bilo dovolj, da razumni osebi prenese pomembne gene, ki so mu okrepili imuniteto.
Ker je bilo ugotovljeno, da imajo ljudje, ki zdaj živijo zunaj Afrike, več skupnega z neandertalci kot z Afričani, je logično domnevati, da se je križanje odvijalo zunaj Črnega kontinenta, ko so se na Bližnjem vzhodu začele naseljevati prve skupine homo sapiensov (ne prej kot 100 tisoč let) nazaj).
Obstaja še eno, bolj kompleksno stališče: neandertalci in sodobni neafričani so imeli skupnega prednika, ki se je pred približno 230 tisoč leti odcepil od prednikov sodobnih Afričanov. Drugi scenarij je teoretično mogoč, vendar so zadnje raziskave že večkrat potrdile prvo hipotezo. Tokrat ni bilo občutka: analiza 780.000 genetskih različic 125 ljudi, ki predstavljajo sedem skupin Severnoafričanov, je pokazala, da je v teh DNK veliko več neandertalčeve DNK kot pri podsaharskih Afričanih.
Raven neandertalskih genov v teh populacijah je primerljiva z evroazijsko. Znanstveniki so tudi ugotovili, da je ta neandertalski genetski signal večji pri tistih severnoafriških populacijah, katerih predniki so imeli razmeroma malo križanja s sodobnimi prebivalci Bližnjega vzhoda in Evrope. To kaže, da signal prihaja neposredno iz starodavnih križanj z neandertalci in ne iz nedavnih povezav z drugimi ljudmi, katerih predniki so bili zmedeni z drugo vrsto.
Tako so edine populacije sodobnega človeštva brez neandertalčeve mešanice skupine južno od Sahare. Po mnenju raziskovalcev dobljeni rezultati ne pomenijo, da so neandertalci migrirali v Afriko in tam stopili v stik z lokalnim prebivalstvom.
Intimnejša situacija se je bolj verjetno razvila na Bližnjem vzhodu, od koder so se nekatere skupine vrnile nazaj v Severno Afriko in izenačile ali iztrebile prebivalstvo svojih prednikov. Poleg tega študija namiguje, da prebivalstvo Severne Afrike ni vir migracij na Bližnji vzhod. Najverjetneje so pionirji postali prebivalci Vzhodne Afrike. Rezultati genetske analize so objavljeni v reviji PLoS ONE.