Znanstveniki so v Braziliji odkrili nov virus, katerega DNK predstavlja 90 odstotkov genov, ki jih znanost ne pozna. Rezultati odkritja so objavljeni na spletnem mestu za tisk bioRxiv.
Virus so odkrili v umetnem jezeru Pampulha v brazilskem mestu Belo Horizonte. Njen ne zelo zapleten genom je skoraj v celoti sestavljen iz neznanih genov znanosti. Avtorji so novi virus Yaravirus brasiliensis poimenovali po vodni nimfi Yara iz mitologije ljudstev Južne Amerike.
Znanstveniki ugibajo, da se soočajo s prvim primerom neznane izolirane skupine virusov ali oddaljene vrste velikanskega virusa, ki se je razvil v manjšo obliko.
Velikanski virusi, ki so jih odkrili šele v 21. stoletju, dosegajo velikosti, primerljive z bakterijskimi celicami. Ime so dobile po svojih ogromnih kapsidah - beljakovinskih membranah, ki obdajajo virione - virusne delce. Imajo tudi DNK ustrezne dolžine, ki presega 200 tisoč baznih parov in pogosto vsebuje tako imenovane sirote ali sirote gene (ORFan), ki jih ne najdemo nobena druga skupina organizmov.
Kompleksni genomi omogočajo velikanskim virusom sintetiziranje beljakovin in zato izvajajo popravljanje, podvajanje, prepisovanje in prevajanje DNK. Pred njihovim odkritjem je veljalo, da virusi nimajo takšnih sposobnosti, saj gre za inertna bitja, ki lahko okužijo le svoje gostitelje. Vsi znani orjaški virusi so paraziti ameb.
In čeprav je velikost novega mikroorganizma bistveno manjša od velikosti velikanskih virusov - približno 80 nanometrov -, parazitira tudi na amebah, njegov genom pa je skoraj povsem osiroten: 68 njegovih genov (več kot 90 odstotkov) ne najde analogov v nobenem znanem organizmu in le šest nejasno podobni tistim, ki jih pozna znanost.
"To je zato, ker je virus nova generacija amebičnega virusa neverjetnega izvora in filogenije," je v sporočilu za javnost dejal eden od voditeljev študije Jônatas Abrahão z zvezne univerze Minas Gerais v Braziliji.
Znanstveniki so analizirali več kot osem in pol tisoč metagenomov, vendar med njimi niso našli virusov, povezanih z novim mikroorganizmom. Tako kot drugi virusi te skupine je tudi ta predstavljen z dvoverižno DNK, katere dolžina je 44.900 baznih parov in vsebuje 74 kodirajočih fragmentov.
Promocijski video:
"Z uporabo standardnih protokolov naša prva genetska analiza ni uspela odkriti prepoznavnih kapsidnih sekvenc ali drugih klasičnih virusnih genov v yaravirusu," pojasnjuje Yonatas Abrajao in vodja druge študije Bernard La Scola z univerze Aix-Marseille v Francija.
Po uradnih metagenomskih protokolih yaravirusa sploh ni mogoče prepoznati kot virusno sredstvo, ker nima jasne podobnosti z njimi. Znanstveniki še ne morejo povedati, kaj v resnici je - predstavnik povsem nove skupine ali potomec orjaškega virusa, ki se je nekako razvil v manjšo obliko.
"Število neznanih beljakovin, ki sestavljajo delce yaravirusa, odraža spremenljivost, ki obstaja v virusnem svetu, in koliko novih virusnih genomov je še treba odkriti," ugotavljajo avtorji.