Včasih se na svetu dogajajo čudeži, ki jih je s stališča znanosti težko razložiti, pojavljajo pa se različice o posredovanju določene entitete, ki se v religiji imenuje Bog, Stvarnik, pa tudi druge močne entitete. Znanstveniki že dolgo poskušajo razložiti skrivnost svetega ognja, saj verjamejo, da je to morda ena največjih prevar človeštva. Skeptiki pogosto uporabljajo različne metode, da izključijo možnost božanskega in mističnega v našem svetu.
Obstaja več različic nastanka Svetega ognja, med njimi je teorija tujerodnega izvora in različice kemičnih procesov, ki jih mnogi ljudje morda ne bodo razumeli in verjamejo v božanski čudež. Ministri različnih religij znanstvenikom pogosto ne dovolijo raziskovanja različnih svetišč in artefaktov, včasih pa se to tudi zgodi. Leta 2008 se je na primer leta 2008 ruskemu fiziku Andreju Volkovu uspelo približati skrivnosti Svetega ognja, vendar njegove raziskave skoraj ne moremo imenovati argumentov v prid znanosti, to je zapisal:
Kljub čudnemu incidentu z Volkovim resnično ne verjamem v božanski izvor tega čudeža. Zdi se mi, da gre za versko prevaro, da ljudje prepričajo veliko število ljudi v obstoj in moč Boga. Cerkveni delavci pogosto delajo take korake, vendar znanstvenikom pogosto preprečujejo raziskovanje takšnih čudežev.